MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV1

Total Repeats: 5513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015178	CCA	2	6	48335	48340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113041
1002	NC_015178	TCG	2	6	48437	48442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113041
1003	NC_015178	ACCC	2	8	48481	48488	25 %	0 %	0 %	75 %	325113041
1004	NC_015178	CTG	2	6	48582	48587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113042
1005	NC_015178	CAT	2	6	48591	48596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113042
1006	NC_015178	GTCC	2	8	48624	48631	0 %	25 %	25 %	50 %	325113042
1007	NC_015178	GCC	2	6	48711	48716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113043
1008	NC_015178	ACC	2	6	48744	48749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113043
1009	NC_015178	GCC	2	6	48792	48797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113043
1010	NC_015178	ACC	2	6	48825	48830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113043
1011	NC_015178	GCG	2	6	48923	48928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113044
1012	NC_015178	TGC	2	6	48957	48962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113044
1013	NC_015178	CGG	2	6	48978	48983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113044
1014	NC_015178	AGG	2	6	49011	49016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113044
1015	NC_015178	CCA	2	6	49058	49063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113044
1016	NC_015178	GCCA	2	8	49144	49151	25 %	0 %	25 %	50 %	325113044
1017	NC_015178	GCC	2	6	49162	49167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113044
1018	NC_015178	GGT	2	6	49172	49177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113044
1019	NC_015178	TCCG	2	8	49263	49270	0 %	25 %	25 %	50 %	325113044
1020	NC_015178	AGC	2	6	49332	49337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113044
1021	NC_015178	CGC	2	6	49351	49356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113044
1022	NC_015178	CGT	2	6	49402	49407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113044
1023	NC_015178	ATC	2	6	49412	49417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325113044
1024	NC_015178	CCA	2	6	49471	49476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113044
1025	NC_015178	TGA	2	6	49495	49500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113044
1026	NC_015178	GCG	2	6	49517	49522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113044
1027	NC_015178	GAC	2	6	49568	49573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113044
1028	NC_015178	GC	3	6	49588	49593	0 %	0 %	50 %	50 %	325113044
1029	NC_015178	CCGATC	2	12	49632	49643	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325113044
1030	NC_015178	CCG	2	6	49665	49670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113045
1031	NC_015178	GCGCCG	2	12	49698	49709	0 %	0 %	50 %	50 %	325113045
1032	NC_015178	GGT	2	6	49750	49755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113045
1033	NC_015178	GCT	3	9	49764	49772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113045
1034	NC_015178	CGGCC	2	10	49773	49782	0 %	0 %	40 %	60 %	325113045
1035	NC_015178	GGC	2	6	49814	49819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113045
1036	NC_015178	ACC	2	6	49877	49882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113045
1037	NC_015178	GTG	2	6	49883	49888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113045
1038	NC_015178	AGCG	2	8	49900	49907	25 %	0 %	50 %	25 %	325113045
1039	NC_015178	CCG	2	6	49934	49939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113045
1040	NC_015178	CGC	2	6	49970	49975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113045
1041	NC_015178	CCG	2	6	49984	49989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113045
1042	NC_015178	CGG	2	6	50004	50009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113045
1043	NC_015178	GCG	4	12	50012	50023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113045
1044	NC_015178	GAT	2	6	50044	50049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113045
1045	NC_015178	GGT	2	6	50080	50085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113045
1046	NC_015178	CTC	3	9	50086	50094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113045
1047	NC_015178	CCCG	2	8	50207	50214	0 %	0 %	25 %	75 %	325113045
1048	NC_015178	GGGC	2	8	50259	50266	0 %	0 %	75 %	25 %	325113045
1049	NC_015178	GGA	2	6	50269	50274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325113045
1050	NC_015178	GA	3	6	50273	50278	50 %	0 %	50 %	0 %	325113045
1051	NC_015178	TCG	2	6	50279	50284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113045
1052	NC_015178	CGC	2	6	50314	50319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113045
1053	NC_015178	GAAA	2	8	50365	50372	75 %	0 %	25 %	0 %	325113045
1054	NC_015178	C	6	6	50391	50396	0 %	0 %	0 %	100 %	325113046
1055	NC_015178	GAA	2	6	50406	50411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113046
1056	NC_015178	GCCGC	2	10	50427	50436	0 %	0 %	40 %	60 %	325113046
1057	NC_015178	CGC	2	6	50463	50468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113046
1058	NC_015178	CCG	2	6	50477	50482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113046
1059	NC_015178	GCT	2	6	50498	50503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113046
1060	NC_015178	CGCC	2	8	50583	50590	0 %	0 %	25 %	75 %	325113046
1061	NC_015178	CCGG	2	8	50723	50730	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1062	NC_015178	GCC	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113046
1063	NC_015178	CG	3	6	50764	50769	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1064	NC_015178	GCA	2	6	50773	50778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113046
1065	NC_015178	GGC	2	6	50780	50785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113046
1066	NC_015178	CAGC	2	8	50814	50821	25 %	0 %	25 %	50 %	325113046
1067	NC_015178	GA	3	6	50861	50866	50 %	0 %	50 %	0 %	325113046
1068	NC_015178	GC	3	6	50890	50895	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1069	NC_015178	GTC	2	6	50898	50903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113046
1070	NC_015178	GCG	2	6	50966	50971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113046
1071	NC_015178	CG	4	8	51002	51009	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1072	NC_015178	GCG	4	12	51007	51018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113046
1073	NC_015178	GCC	2	6	51058	51063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113046
1074	NC_015178	CG	3	6	51195	51200	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1075	NC_015178	CCGG	2	8	51263	51270	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1076	NC_015178	CG	3	6	51274	51279	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1077	NC_015178	CGG	2	6	51293	51298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113046
1078	NC_015178	TGCC	2	8	51309	51316	0 %	25 %	25 %	50 %	325113046
1079	NC_015178	GC	3	6	51460	51465	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1080	NC_015178	CCG	2	6	51473	51478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113046
1081	NC_015178	CGG	2	6	51489	51494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113046
1082	NC_015178	GC	3	6	51523	51528	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1083	NC_015178	GCT	2	6	51532	51537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113046
1084	NC_015178	CCGGA	2	10	51566	51575	20 %	0 %	40 %	40 %	325113046
1085	NC_015178	CGT	2	6	51636	51641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113046
1086	NC_015178	GC	5	10	51703	51712	0 %	0 %	50 %	50 %	325113046
1087	NC_015178	CACT	2	8	51713	51720	25 %	25 %	0 %	50 %	325113046
1088	NC_015178	GCG	2	6	51764	51769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1089	NC_015178	GGC	2	6	51790	51795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1090	NC_015178	CGG	2	6	51811	51816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1091	NC_015178	CGA	2	6	51829	51834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113047
1092	NC_015178	GCGGT	2	10	51843	51852	0 %	20 %	60 %	20 %	325113047
1093	NC_015178	CGG	2	6	51859	51864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1094	NC_015178	GCA	2	6	51898	51903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113047
1095	NC_015178	AAG	2	6	51919	51924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113047
1096	NC_015178	ACC	2	6	51933	51938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113047
1097	NC_015178	TCC	2	6	51975	51980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113047
1098	NC_015178	CAC	2	6	52100	52105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113047
1099	NC_015178	CGG	3	9	52150	52158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1100	NC_015178	AGGC	2	8	52165	52172	25 %	0 %	50 %	25 %	325113047
1101	NC_015178	GC	4	8	52204	52211	0 %	0 %	50 %	50 %	325113047
1102	NC_015178	GGC	2	6	52213	52218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1103	NC_015178	GCT	2	6	52222	52227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113047
1104	NC_015178	GA	3	6	52248	52253	50 %	0 %	50 %	0 %	325113047
1105	NC_015178	CGC	2	6	52286	52291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113047
1106	NC_015178	GCG	2	6	52296	52301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1107	NC_015178	TCG	2	6	52320	52325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113047
1108	NC_015178	GGC	2	6	52386	52391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113047
1109	NC_015178	AGAC	2	8	52410	52417	50 %	0 %	25 %	25 %	325113047
1110	NC_015178	ATGAA	2	10	52485	52494	60 %	20 %	20 %	0 %	325113047
1111	NC_015178	GGC	2	6	52525	52530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113048
1112	NC_015178	CG	3	6	52555	52560	0 %	0 %	50 %	50 %	325113048
1113	NC_015178	GGCG	2	8	52572	52579	0 %	0 %	75 %	25 %	325113048
1114	NC_015178	GCG	2	6	52592	52597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113048
1115	NC_015178	GCGG	2	8	52633	52640	0 %	0 %	75 %	25 %	325113048
1116	NC_015178	G	6	6	52647	52652	0 %	0 %	100 %	0 %	325113048
1117	NC_015178	CGG	2	6	52719	52724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113048
1118	NC_015178	AAG	2	6	52732	52737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325113048
1119	NC_015178	GGC	2	6	52739	52744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113048
1120	NC_015178	CGG	3	9	52758	52766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113048
1121	NC_015178	GCT	2	6	52774	52779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113048
1122	NC_015178	CGC	2	6	52788	52793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113048
1123	NC_015178	CGT	2	6	52828	52833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325113048
1124	NC_015178	CAC	2	6	52884	52889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325113049
1125	NC_015178	GCA	2	6	52952	52957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113049
1126	NC_015178	CGG	2	6	52973	52978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113049
1127	NC_015178	CAG	2	6	52989	52994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113049
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1235	NC_015178	GGGGC	2	10	57089	57098	0 %	0 %	80 %	20 %	325113054
1236	NC_015178	CGG	2	6	57101	57106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113054
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1238	NC_015178	AGCCG	2	10	57278	57287	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
1239	NC_015178	GCA	2	6	57308	57313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113054
1240	NC_015178	GCAG	2	8	57349	57356	25 %	0 %	50 %	25 %	325113054
1241	NC_015178	GCAGC	2	10	57503	57512	20 %	0 %	40 %	40 %	325113054
1242	NC_015178	CGGCCG	2	12	57580	57591	0 %	0 %	50 %	50 %	325113054
1243	NC_015178	GCA	2	6	57695	57700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113054
1244	NC_015178	CCG	2	6	57713	57718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113054
1245	NC_015178	CGG	3	9	57737	57745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113054
1246	NC_015178	GCGCG	2	10	57806	57815	0 %	0 %	60 %	40 %	325113054
1247	NC_015178	GCC	2	6	57856	57861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113054
1248	NC_015178	GCGATG	2	12	57877	57888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325113054
1249	NC_015178	GC	6	12	57889	57900	0 %	0 %	50 %	50 %	325113054
1250	NC_015178	GGGTCG	2	12	57910	57921	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325113054
1251	NC_015178	GCC	2	6	57934	57939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325113054
1252	NC_015178	CAG	2	6	57948	57953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325113054
1253	NC_015178	GCCAC	2	10	57973	57982	20 %	0 %	20 %	60 %	325113054
1254	NC_015178	GC	3	6	57997	58002	0 %	0 %	50 %	50 %	325113054
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1257	NC_015178	GGC	2	6	58076	58081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325113054
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1270	NC_015178	GGT	2	6	58546	58551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325113055
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1370	NC_015178	GAT	2	6	63246	63251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113058
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1373	NC_015178	TCC	3	9	63313	63321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325113058
1374	NC_015178	GAT	2	6	63330	63335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325113058
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1500	NC_015178	GCCC	2	8	67963	67970	0 %	0 %	25 %	75 %	325113062

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